Οι ασθενείς απευθύνονται στο Τμήμα Κίνησης Ασθενών και το Λογιστήριο Ασθενών για εκτίμηση κόστους νοσηλείας, χρεώσεις και τρόπους εξόφλησης. Εκεί ενημερώνονται και για την κάλυψη που προσφέρει ο Ασφαλιστικός Φορέας, αλλά και για υπηρεσίες που δεν καλύπτονται από αυτόν.
Σε κάποιες περιπτώσεις, ζητείται προκαταβολή κατά την εισαγωγή, βάσει του εκτιμώμενου χρόνου νοσηλείας. Η εξόφληση του λογαριασμού γίνεται την ημέρα του εξιτηρίου μόνο στο ταμείο του Ωνάσειου, με μετρητά, κατάθεση σε τραπεζικό λογαριασμό ή πληρωμή με πιστωτική κάρτα.
